Aplicación de la técnica de PCR en la detección de Ralstonia solanacearum en campos paperos
DOI:
https://doi.org/10.26461/07.08Palavras-chave:
Murchera, Solanum tuberosum, PersistenciaResumo
La murchera de la papa causada por Ralstonia solanacearum es una amenaza permanente para el cultivo con consecuencias devastadoras en condiciones predisponentes. La incidencia de esta enfermedad en Uruguay es variable; desde la década de 1970 se registran brotes agudos periódicos difíciles de prevenir y controlar. Se ha detectado a R. solanacearumen todas las regiones de producción, lo que dificulta el mantenimiento de áreas libres de patógeno y la continuidad del cultivo. Dado que no existen agentes químicos efectivos, las estrategias de control apuntan a la prevención, recomendando la rotación de cultivos, la desinfección de herramientas y el uso de semilla certificada libre del patógeno. En este trabajo se optimizó la detección molecular de R. solanacearum en suelo mediante PCR con el objetivo de conocer la persistencia del patógeno en el campo. El método se aplicó al análisis de tres campos con diferentes antecedentes de murchera, y se demostró que el patógeno es capaz de permanecer viable por más de 10 años. También se determinaron las ventajas y limitaciones de esta metodología en su aplicación a muestras complejas. Estos resultados constituyen un importante aporte que genera conocimiento que permitirá a los productores delinear mejores estrategias para el manejo de la enfermedad al momento de planificar los cultivos.
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Referências
ALEXANDER, Emily; PHAM, Dat; STECK, Todd R. The Viable-but-Nonculturable condition is induced by copper in Agrobacterium tumefaciens and Rhizobium leguminosarum. En: Applied and Environmental Microbiology. 1999, 65: 83754–3756
ALVAREZ, B.; BIOSCA, E. G.; LÓPEZ M. M. On the life of Ralstonia solanacearum, a destructive bacterial plant pathogen. En: A. Mendez-Vilas (ed.), Current research, technology and education topics in applied microbiology and microbial biotechnology, vol. 1. Formatex, Badajoz, España. pp. 267–279, 2010.
CLSI. MM18A. Interpretive Criteria for identification of bacteria and fungi by DNA target sequencing; Approved Guideline. 2008.
DENNY, T.P. Plant pathogenic Ralstonia species. En: Plant-Associated Bacteria. S.S. Gnanamanickam ed. Springer Publishing, Dordrecht, The Netherlands. pp 573-644, 2006.
DUMONTIER, Michel; HOGUE, Christopher W.V. NBLAST: a cluster variant of BLAST for NxN comparisons. En: BMC Bioinformatics. 2002, 3:13
ELPHINSTONE, J. G. Survival and possibilities for extinction of Pseudomonas solanacearum (Smith) Smith in cool climates. En: Potato Research. 1996, 39:403-410.
ENGLEBRETCH, M.C. Modifications of a semi-selective medium for the isolation of Pseudomonas solanacearum. En: Bacterial Wilt Newsletter. 1994, 10:3-5.
FEGAN, Mark; PRIOR, Philippe. How complex is the Ralstonia solanacearum specie complex? En: Bacterial Wilt Disease and the Ralstonia solanacearum specie complex, pp.437-445. Editado por Allen C., Prior P., Hayward A.A. 2005.
GRANADA, G.A.; SEQUEIRA, L. Survival of Pseudomonas solanacearum in soil, rhizosphere and plant roots. En: Canadian Journal of Microbiology 1983, 29: 433-440.
GREY, B. E.; STECK, T. R. The viable but nonculturable state of Ralstonia solanacearum may be involved in long-term survival and plant infection. En: Applied and Environmental Microbiology. 2001, 67: 3866-3872.
HAYWARD, A.C. Biology and epidemiology of bacterial wilt caused by Pseudomonas solanacearum. En: Annual Review of Phytopathology. 1991, 29:65 -87.
LIN, Chih-Hung; HSU, Shih-Tien; TZENG, Kuo-Ching; and WANG Jaw-Fen. Detection of race 1 strains of Ralstonia solanacearum in field samples in Taiwan using a BIO-PCR method.En: European Journal of Plant Pathology.2009,124 (1):75-85
JANSE, J.D.; VAN DEN BELD, H.E.; ELPHINSTONE, J.; SIMPKINS, S.; TJOU-TAM-SIN, N.N.A.; VAN VAERENBERGH, J. En: Introduction to Europe of Ralstonia solanacearum biovar 2, race 3 in Pelargonium zonale cuttings. Journal of Plant Pathology. 2004, 86(2):147-155.
KELMAN, A. The relationship of pathogenicity in Pseudomonas solanacerum to colony appearance on a tetrazolium medium. En: Phytopathology. 1954, 44: 693-695.
MCDOUGALD, Diane; RICE, Scott A.; WEICHART, Dieter; KJELLEBERG, Staffan. Nonculturability: adaptation or debilitation? En: FEMS Microbiology Ecology. 1998, 25: 1-9.
MGAP-DIEA. Caracterización de la producción de papa. Encuesta 2003. [En línea] En: Boletín Informativo, Serie Encuestas Nro. 214. Montevideo, Junio 2003. [Consulta: Junio 2012]. Disponible en: http://www.mgap.gub.uy/portal/hgxpp001.aspx?7,5,90,O,S,0,SRC;90;0;63843;A;SRC;MNU;E;2;16;10;6;MNU;,
MGAP. Resolución Ministerial Nº 864/10. (Uruguay). Aprobación en las modificaciones al estándar específico para producción de materiales de propagación de papa (Solanum tuberosum) de clase certificada. 1º de noviembre de 2010.
MOFFETT, M.L.; GILES, J. E.; WOOD B. A. Survival of Pseudomonas solanacearum biovars 2 and 3 in soil: effect of moisture and soil type. En: Soil Biology and Biochemistry. 2002, 15(5): 587-591.
PASTRIK, K.H.; MAISS, E. Detection of Ralstonia solanacearum in potato tubers by Polymerase Chain Reaction. En: Journal of Phytopathology. 2000, 148. 619-626
.
PICARD, C.; PONSONNET, C; PAGET, E.; NESME, X., SIMONET, P. Detection and enumeration of bacteria in soil by direct DNA extraction and polymerase chain reaction. En: Applied and Environmental Microbiology. 1992, 58, 2717-2722.
PRADHANANG, P.M.; ELPHINSTONE, J.G.; FOX R.T.V. Sensitive detection of Ralstonia solanacearum in soil: a comparison of different detection techniques. En: Plant Pathology. 2000, 49: 414-422.
SADDLER, G.S. Management of bacterial wilt disease. En: Bacterial Wilt: The Disease and the Ralstonia solanacearum Species Complex. C. Allen, P. Prior, and A.C. Hayward, eds. American Phytopathological Society, St. Paul, MN. pp. 121 -132, 2005.
SAMBROOK, J.; RUSSELL, D. Molecular cloning: a laboratory manual. 3era edición. Editorial Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York. 2001.
SANABRIA, Analía; SIRI, María Inés; GRELA, Alfonso; PIANZZOLA, María Julia. Study of the persistence of Ralstonia solanacearum in soils focused to obtain a better advantage of the potato fields. En: 6th Latin American Biodeterioration and Biodegradation Symposium. Bogotá, Colombia, 2007.
SCHELL, Marc A. Control of virulence and pathogenicity genes of Ralstonia solanacearum by an elaborate sensory network. En: Annual Review of Phytopathology. 2000, 38: 263-292.
SEAL, S.E.; TAGHAVI, M.; FEGAN, N.; HAYWARD, A.C.; FEGAN, M. Determination of Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum rDNA subgroups by PCR tests. En: Plant Patholology. 1999, 48: 115-120.
SIRI, María Inés; CECCHETTO, Gianna; ALDABE, Luis; SANTOS, Cecilia; SILVERA, Elisa; QUIRICI, Lorena; GALVÁN, Guillermo; VILARÓ, Francisco; PIANZZOLA, María Julia. Persistencia de Ralstonia solanacearum en chacras de Uruguay: diagnóstico molecular de muestras de suelo y susceptibilidad de Solanáceas nativas. En: X Congreso Nacional de la Sociedad Uruguaya de Hortifruticultura, (Montevideo, 23-25 de mayo de 2005). Montevideo, Sociedad Uruguaya de Hortifruticultura, 2005.
SIRI, María Inés; SANABRIA, Analía; PIANZZOLA, María Julia. Genetic diversity and aggressiveness of Ralstonia solanacearum strains causing bacterial wilt of potato in Uruguay. En: Plant Disease. 2011, 95(10); 1292-1301.
VAN ELSAS, Jan Dirk; KASTELEIN, Pieter; VAN BEKKUM, Petra; VAN DER WOLF, Jean M., DE VRIES, Philippine M.; VAN OVERBEEK, Leo S. Survival of Ralstonia solanacearum biovar 2, the causative agent of potato brown rot, in field and microcosm soils in temperate climates. En: Phytopathology. 2000, 90: 1358-1366.
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